La haute vallée de la Garonne, partie où la Garonne rentre en France, abrite trois sites Natura 2000 :
- Haute vallée de la Garonne FR 7300883
- Zones rupestres xerothermiques des bassins de Marinac Saint Béat Pic de Gar Montagne de Rie Fr 7300884
- Garonne amont FR 7300 pour en savoir plus sur ce site cliquez ici
Ce sont deux sites de montagne qui vont de 515 à 2629 m d'altitude. On y rencontre des habitats naturels variés qui vont de la vallée jusqu'à la haute montagne.